Chấn thương gặp phải trong giai đoạn chuẩn bị cho AFF Cup 2016 khiến Tuấn Anh chưa thể ra sân một trận đấu chính thức nào kể từ đó đến nay dù anh từng góp mặt trong trận giao hữu giữa HAGL và đội U18 Mito Hollyhock cách đây chưa lâu. Trong các buổi tập ở CLB HAGL thời gian gần đây, Tuấn Anh thường xuyên được bác sĩ của đội bóng kiểm tra 3 yếu tố là sức bền tuần hoàn, sức bền hệ cơ và sức bền năng lượng. Tuấn Anh đáp ứng rất tốt tất cả các tiêu chí trong bài chạy sức bền 4 km. Dù vậy, BHL của HAGL vẫn quyết định tiếp tục hoãn ngày tái xuất của Tuấn Anh bởi lo ngại cầu thủ này có thể tái phát chấn thương nếu trở lại sớm hơn dự định ban đầu.

HLV Nguyễn Quốc Tuấn của CLB Hoàng Anh Gia Lai cho biết: "Về phía BHL chúng tôi thì chủ yếu tạo không khí tập luyện cho Tuấn Anh chứ thực sự để thi đấu thì chúng tôi còn hết sức dè dặt. Vì còn phải đảm bảo thể lực thì mới có thể thi đấu được. Nếu thể lực không đảm bảo mà vào thi đấu là rất dễ chấn thương tái phát. Nên chúng tôi rất cẩn thận với vấn đề này".

Bất chấp sự thận trọng từ phía CLB, tiền vệ tài hoa này vẫn được HLV Hữu Thắng triệu tập lên ĐT U22 Việt Nam. Đây là quyết định đã được dự báo từ trước. Tuy nhiên, với tình hình thể lực hiện tại, Tuấn Anh khó có thể đá chính trong trận đấu sắp tới với U20 Argentina. Đây có lẽ chỉ là một phép tính cho tương lai của HLV Hữu Thắng khi ông muốn Tuấn Anh làm quen với cảm giác cũng như môi trường trong đội, lực lượng nòng cốt dự SEA Games 29. Vì thế, hơn 1 tuần tập trung sắp tới sẽ là quãng thời gian quan trọng để HLV Hữu Thắng có đánh giá chính xác nhất về thể trạng của Tuấn Anh, trước khi tính toán xa hơn cho 3 tháng tới. Do đó, tiền vệ này sẽ càng phải nỗ lực hơn để khẳng định mình, trong cảnh tất cả sẽ nhìn vào anh ở ngày đầu tiên trở lại cấp độ đội tuyển sau thời gian dài điều trị chấn thương.